許多凈化微生物實驗室存在嚴重的污染問題，而其中又以廢液廢品的處理為最，大部分實驗室在進行生物實驗過程中產(chǎn)生的大量高濃度含有害微生物的培養(yǎng)液、培養(yǎng)基，未經(jīng)適當?shù)臏缇幚矶苯油馀牛以S多實驗室的下水道與附近居民的下水道相通，污染物通過下水道形成交叉污染，最后流入河中或者滲入地下，時間長了將造成不可估量的危害。

由于目前雖然國家環(huán)保總局將各類實驗室納入環(huán)保監(jiān)管范圍，但是許多實驗室仍然處于監(jiān)控真空狀態(tài)，缺乏規(guī)章制度、缺乏實驗室污染控制的經(jīng)費投入、缺乏對實驗室的監(jiān)管等各種原因?qū)е铝藢嶒炇页蔀榱宋廴驹?，對環(huán)境造成了威脅，這些種種都需要社會各界的共同關(guān)注。

凈化微生物實驗室產(chǎn)生的廢液污染主要是化學(xué)性污染和生物性污染，另外還有放射性污染，化學(xué)性污染包括有機物污染和無機物污染。有機物污染主要是有機試劑污染和有機樣品污染。在大多數(shù)情況下，實驗室中的有機試劑并不直接參與發(fā)生反應(yīng)，僅僅起溶劑作用，因此消耗的有機試劑以各種形式排放到周邊的環(huán)境中，排放總量大致就相當于試劑的消耗量。日復(fù)一日，年復(fù)一年，排放量十分可觀。有機樣品污染包括一些劇毒的有機樣品，如農(nóng)藥、苯并(α)芘、黃曲霉毒素、亞硝胺等。無機物污染有強酸、強堿的污染，重金屬污染，氰化物污染等。其中汞、砷、鉛、鎘、鉻等重金屬的毒性不僅強，且有在人體中有蓄積性。

生物性污染包括生物廢棄物污染和生物細菌毒素污染。生物廢棄物有檢驗實驗室的標本，如血液、尿、糞便、痰液和嘔吐物等；檢驗用品，如實驗器材、細菌培養(yǎng)基和細菌陽性標本等。凈化微生物實驗室的通風設(shè)備設(shè)計不完善或?qū)嶒炦^程個人安全保護漏洞，會使生物細菌毒素擴散傳播，帶來污染，甚至帶來嚴重不良后果。2003年非典流行肆虐后，許多凈化微生物實驗室加強對SAS病毒的研究，之后報道的非典感染者，多是科研工作者在實驗室研究時被感染的。

在對這些污染處理的時候，需要注意以下幾個方面：

廢液的濃度超過規(guī)定的濃度時，必須進行處理。但處理設(shè)施比較齊全時，往往把廢液的處理濃度限制放寬。

最好先將廢液分別處理，如果是貯存后一并處理時，雖然其處理方法將有所不同，但原則上要將可以統(tǒng)一處理的各種化合物收集后進行處理。

處理含有絡(luò)離子、螯合物之類的廢液時，如果有干擾成份存在，要把含有這些成份的廢液另外收集。

下面所列的廢液不能互相混合：

①過氧化物與有機物；②氰化物、硫化物、次氯酸鹽與酸；③鹽酸、氫氟酸等揮發(fā)性酸與不揮發(fā)性酸；④濃硫酸、磺酸、羥基酸、聚磷酸等酸類與其它的酸；⑤銨鹽、揮發(fā)性胺與堿。

要選擇沒有破損及不會被廢液腐蝕的容器進行收集。將所收集的廢液的成份及含量，貼上明顯的標簽，并置于安全的地點保存。特別是毒性大的廢液，尤要十分注意。

對硫醇、胺等會發(fā)出臭味的廢液和會發(fā)生氰、磷化氫等有毒氣體的廢液，以及易燃性大的二硫化碳、乙醚之類廢液，要把它加以適當?shù)奶幚?，防止泄漏，并?yīng)盡快進行處理。

含有過氧化物、硝化甘油之類爆炸性物質(zhì)的廢液，要謹慎地操作，并應(yīng)盡快處理。

含有放射性物質(zhì)的廢棄物，用另外的方法收集，并必須嚴格按照有關(guān)的規(guī)定，嚴防泄漏，謹慎地進行處理;放射性同位素實驗室生成的所有廢棄物、動物尸體必須經(jīng)有效衰變并經(jīng)同位素輻射監(jiān)測合格后，才能按照一般廢棄物、動物尸體進行處置;有關(guān)放射性核素的實驗操作必須在指定的同位素實驗室進行;購買放射性核素必須向同位素實驗室負責人申請，辦理登記手續(xù)。購買、領(lǐng)取、使用、歸還放射性同位素時應(yīng)正確登記、認真檢查，做到帳物相符.

另外在處理那些經(jīng)過或事先未經(jīng)清除污染的動物尸體以及解剖組織或其他實驗室廢棄物時，焚燒是一種有效的方法。只有在實驗室可以控制焚燒爐的條件下，才能用焚燒代替高壓滅菌來處理感染性物質(zhì)。

需要有效控制溫度，并配備二級焚燒室時才能實現(xiàn)徹底焚燒。許多焚燒爐，尤其是那些只有

單個焚燒室的，不能滿足處理感染性物質(zhì)、動物尸體和塑料制品的要求。這些材料可能不能完全銷毀，微生物、有毒化學(xué)品和煙塵還可能通過煙囪排放而污染大氣。但也有許多結(jié)構(gòu)令人滿意的焚燒室。理想的是一級焚燒室的溫度至少應(yīng)達到800℃，二級焚燒室的溫度至少應(yīng)達到1000℃。需要焚燒的材料（即使事先已清除污染）應(yīng)當用袋子運送到焚燒室，最好使用塑料袋。負責焚燒的工作人員應(yīng)當接受關(guān)于如何裝載和控制溫度等的正確指導(dǎo)。還需要注明的是，焚燒爐的操作是否有效主要取決于對需要處理的廢棄物中物品的正確混合。

人們已經(jīng)關(guān)注到現(xiàn)有的或計劃制造中的焚燒爐可能對環(huán)境造成的負面影響，并正努力使焚燒爐對環(huán)境的影響更小，也更節(jié)約能源。

實驗室和醫(yī)學(xué)廢棄物的處理要遵守各個地區(qū)、國家和國際的規(guī)定，在設(shè)計和執(zhí)行關(guān)于生物危害性廢棄物處理、運輸和廢棄的規(guī)劃之前，必須參考最新版的相關(guān)文件。一般情況下，焚燒爐內(nèi)的灰燼可以作為普通家庭廢棄物處理并由地方有關(guān)部門運走。高壓滅菌過的廢棄物可以在其他地方焚燒后處理，或在指定垃圾場掩埋處理。